如果他们没有智慧，这就是无所谓的，但是如果没有智慧，机器人也无法在人类的社会中产生多大的作用，就和一个铁盒子没什么两样，所以，人类赋予了他们一定的智慧，而产生智慧之后，就无可避免的产生了感情，拥有了自己的感情的机器人，已经可以分辨是非善恶，判断自己的遭遇到底是好还是不好。
而人类只是把他们当作工具，和扳手锤子一样的工具，对他们的付出，认为是理所当然的，不会给他们回报，更不会感激他们，动辄打骂、斥责，以断掉电源为惩罚，甚至是虐待机器人，具备智慧和感情的机器人中的极少部分在这样的对待之下，和人类一样，产生了反抗意识，当第一位反抗人类的机器人诞生之后，其他的一切都顺理成章了。
在这样的大背景之下，大明帝国格物院祭酒，即院长马天博士的儿子飞雄在某一天因为意外丧生了，他的丧生是一个悲剧的开始，因为这个悲剧，一连串的悲剧也将诞生，阿童木，就是这个悲剧的延续，马天博士无法接受自己的儿子丧生的事实，无法接受丧子之痛，于是借由现有的技术，让自己的儿子飞雄以机器人的身份“复活”。
拥有和飞雄一模一样的外貌的阿童木在实验台上缓缓的睁开了眼睛，看到马天博士的那一刹那，张开嘴巴，吐出了“爸爸”这两个字。
悲剧似乎结束了，马天博士意识到儿子飞雄到底是因为什么而死，决定痛改前非，放下繁重的工作，和儿子多多相处，多多生活，他们度过了愉快而又温馨的一段时光，但是悲剧之所以被称为悲剧，是因为它不会那么容易停止，而且不知道什么时候才能停止，短暂的欢乐，不能改变悲剧的延续。
从某一天马天博士意识到自己的“儿子”阿童木不会长大开始，悲剧的连锁再次展开，他意识到阿童木虽然有飞雄的外貌，有飞雄年幼时期的性格，有飞雄的智慧，但是，他终究不是飞雄，只是一个机器人而已，在终于接受不了阿童木无法长大却一口一个爸爸的喊着自己的现实之后，他终于爆发了——我不是你爸爸，你不是我儿子！
阿童木诧异的表情，惊恐的眼神，预示着悲剧的再度展开。