小智五人再次启程，途中路过了一个满是皮卡丘的森林，小智差点就把皮卡丘留在那里了。（..)后来遇上了一家土豪正在开派对，目的是让四兄弟当中的小弟的伊布选择究竟让他的伊布进化成哪一种形态，当然其中也是有三个哥哥的攀比，究竟哪一个的小精灵更强。
因为阿飞也有一只伊布，三个哥哥的态度十分热情，各自吹捧着自家的伊布进化型。按照当前发现的三种进化形态来看，水精灵克制火精灵，雷精灵又克制水精灵，只有火精灵既被水精灵克制又无法对雷精灵造成优势，不过火系技能的数量很多，而且常规破坏力还是火焰比较高，水只有在巨量的情况下才有杀伤力，雷电容易被引导进而抵挡，所以三个哥哥对小弟的选择十分看重，都把这次选择当成是对自己的认可。
然而事实上是路飞在发现三兄弟居然为了这种事情而争吵的时候爆料了阿飞的伊布，还把王毅交给阿飞的资料抖了出来，伊布剩余的五种进化形态让三兄弟大开眼界，同时也对阿飞的能够自由转换形态的伊布表示出了羡慕之情，不过哪怕许诺了大量的进化石也没能从阿飞手上到伊布，最后还是约定等到阿飞的伊布完全成年了之后再通过生蛋的方式看看能不能得到这样特殊的伊布。
老四的伊布还是没有选定进化形态，借口则是希望培养出亲密度极高的太阳精灵或者夜精灵，要是能够养出仙子精灵（又译梦精灵）就更好了，至于他心底的小打算，永远不让伊布进化，年轻人的小秘密就不要拆穿了。
之后一路上走走停停，有趣的事情也有不少，比如从古代沉睡至今的化石小精灵，原本这应该是给小刚的福利的，谁叫他专注于收服岩石系小精灵呢，不过可惜的是这些化石小精灵被再次埋葬陷入沉睡，至于知道这件事的君沙小姐有没有告知联盟高层，火箭队二人组又有没有上报，小智五人就完全不知道了。
顺带一提，小智在这次事故中意外捡到了一枚精灵蛋，孵化出了十分稀有的小精灵，波克比，话说火箭队的喵猫也为波克比的出生做出了不少贡献，一度以波克比的父母自居，至于究竟是父还是母有待商榷，不过在最后以公平比赛的方式来争夺波克比的归属权的时候喵猫发挥了百分之三百的实力，正面对战竟然战胜了小刚的大岩蛇，以普通系战胜岩石系，逆属性加上火箭队的胜率，这次战斗几乎把喵猫三年内的运气都用光了，但是最后仍旧输给了小智的皮卡丘，所以说爆种要在关键时刻才行，不过猫输给了老鼠，为什么没有人觉得奇怪呢？另外小智也没有获得波克比的抚养权，心机少女小霞靠脸战胜了所有对手，因为是波克比出壳后看到的第一个生物，所以被蛋壳星人当做了母亲，其他人谁都无法影响这种关系。
后来五人又在一个人类医生那里当做治疗小精灵的医疗助手，先不说一个人类医生去治疗小精灵跟兽医给人看病有什么区别，这位对女性很温柔对男性则十分粗暴，治疗手段基本上都是靠胶水粘起来的男医生的名字如果没有听错的话貌似是杜－蕾－斯1？为什么感觉有一股恶意袭来？错觉？最后的最后，在火箭队打算袭击这里的时候，杜医生还暴－露出了自己医生的白大褂之下一排排的手术刀和注射器，貌似这位也是个隐藏bss。所幸最后没有到达需要杜医生出手的地步，火箭队自行退却了。
之后五人还路过了小次郎的老家，众人这才知道平时在火箭队二人组里也是受气包的小次郎居然还是一个乡下土豪的大少爷，小次郎他父母土豪到了什么程度？作为小次郎的**物而不是战斗用小精灵的卡蒂狗的房子就是一栋多层小别墅，想到在天朝绝大多数都只是“租房七十年”的平头百姓们，这大概就是活得不如狗的真实写照吧。
路过一个森林，居然有人，哦不，有鸭子偷小智几人的精灵球，一直以未来的剑侠自居的阿飞和“海贼王的男人”路飞都是心生愤怒，于是在这只自带火锅底料的大葱鸭没能从两位乱入者手下逃走之后的一个小时内，小智五人尝到了神奇宝贝图鉴当中所介绍的“因为跟手中的大葱一起烹饪的话味道十分鲜美，所以被捕捉到数量稀少”的美味，一度产生了要不要留下来几天的想法，不过考虑到野生的大葱鸭肯定是不会偷训练家的精灵球，而这只应该是有主人的大葱鸭已经被众人泄愤吃掉了，虽然对这个指使大葱鸭进行盗窃的家伙感到不爽，但是论起罪过貌似五人组的更大，有些理亏的他们选择了跑路，事后把“这里有人通过大葱鸭盗取行人精灵球”的事情告知了君沙小姐，然后就一身轻松地继续前进了，波克比也正是在这之后才孵化的。
小智的妙蛙种子到了应该进化的阶段了，结果却是出人意料，竟然有不想进化的神奇宝贝！当然皮卡丘不算，那是用进化石进化的，通常情况下，等级达到一定程度的自然进化是不会有意外的，毕竟那是变强的方式，而且是最自然的方式，不过某些小精灵可能执着于过去的外表而选择拒绝，只是数量是绝对的少数。经过了火箭队的“帮助”，妙蛙种子得到了保持自身状态的认可，五人便继续前进。
随后五人组暂时加入了新的同伴，摄影少年小彻，不拍人只拍神奇宝贝，当然偶尔也会在小精灵旁边加入人类的身影，比如在神奇宝贝考试中抽到了双弹****的小智，就在