而经过此次病毒事件，华北方面军虽然等到了援兵，但是却无力向华北地区展开反攻。双方进入了漫长的对峙期，趁此机会，国民政府提出要求，要八路军旅行之前的约定。
接到国民政府发来的电报后，延安方面倒是没有推脱，毕竟这是之前就已经商定好的，没有什么好磨蹭的。
趁此机会，党中央对麾下所有的部队进行了一次大整编，将隶属于中共的所有军队划分成三个兵团，原隶属于延安直属部队以及正在延安周围实施大生产会战的部队整编为留守兵团，计有八路军第385旅，第359旅，警备第1旅，警备第1、第5团，骑兵团及关中警备司令部、保安司令部，再加上从绥察军区以及晋察冀军区等部队调回来的部队，共8万余人。
八路军和新四军所有的部队整编成华北兵团，由朱老总担任兵团司令员、彭老总担任副司令员。整个兵团下辖一个集团军另两个军，合计10个师外加12个纵队，总兵力超过了30万人。
这还仅仅只是正规部队的数量，还不算数量庞大的县大队、区小队以及民兵组织，如果算上这些的话，华北兵团的总兵力至少在50万以上。
而马峥所部整体改编为塞北兵团，原绥察军区实行的军区制度不变，只不过将原来的小军区整编成了大军区。经过整编，塞北兵团下辖绥远、察哈尔、热河、山东4个军区，下辖部队26个步兵师以及大批的技术兵种，总兵力66万人。
此外，党中央还对各兵团的防区进行了详细的划分，即日起马峥所部全体撤回张家口以北，将北平以及大半个河北的地盘全都移交给华北兵团。
同时，将绥西巴彦淖尔全部以及伊克昭盟的一部分旗县划归陕甘宁边区，作为留守兵团的防区。
整编之后，马峥所部撤离了天津，甚至于还将冀南的部队也全部撤到了大同到张家口一线。冀中、冀东以及北平全都交给了华北兵团。而天津则是交给了国民政府一战区主力第14集团军，高树勋的第39集团军则是接收了冀南的防务。