魏征离开了帝都长安，前往了山东道赴任。而在皇太子李世民加封李靖、李绩不久，李世民就下令李靖、李绩分别带领自己的军队，前往泾州。李世民如此安排有两层意思：一是要李靖、李绩他们抵挡突厥的进攻；二则是要看一看李靖、李绩两人的反应，看他二人是否愿意听从他的命令。
李靖、李绩二人没有让皇太子李世民失望，两人都是接到命令后，没有任何迟疑，就率军西进了，一路跋涉，到达了泾州，逼退了突厥大军。
李世民旌表了李靖、李绩两个人，升了他二人的爵位。
数日后，由皇太子李世民的心腹左领军卫大将军程咬金统帅的右骁卫、左、右领军卫大军返回了帝都长安，李世民升了左右金吾卫将军谢叔方的职务，将其调离了左右金吾卫大军，并任命自己的心腹段志玄、柴绍为左、右金吾卫大将军，自此，李世民掌控了帝都长安的八卫大军，并得到了帝都长安另外四卫大军的支持，全面控制了帝都长安的局势。
之后，李世民将目光投向了幽、营二州，那里是燕王李艺的地盘。燕王李艺是一位让李世民深深忌惮的人物，他是太子建成手下最能战的将军，拥有大军三十万，虎踞幽、营二州，势力庞大。李艺是太子建成心腹中的心腹，他本姓罗，是太子建成上奏大唐皇帝李渊，赐予其李姓的，在太子建成的心中，李艺比齐王元吉都要值得信任，太子建成多次举荐、提拔李艺，而李艺也对太子建成忠心耿耿，多次和李世民针锋相对。鉴于李艺和太子建成的关系，李世民知道李艺肯定是要反的，是要为太子建成报仇的，至于什么时候反，那只是迟早的事情。李世民下诏，加封燕王李艺为大唐正一品太尉，掌大唐军事，并诏令李艺接到诏命后，速速进京任职。李世民想通过这种方式，以反证自己的判断。
结果如他所料，李艺没有奉召，而是暗中整顿兵马，扩军备战，李世民和他的谋士们，都知道李艺准备造反了。
八月甲子是个黄道吉日，李世民的登基大典在乾元殿举行，这一年是公元628年，离李世民被立为皇太子仅仅十五天，李世民没有立即改元，而是沿用武德年号，直到年底。
李世民的皇太子妃、长孙无忌的妹妹长孙氏被立为皇后，李世民的妾室、隋炀帝杨广的女儿杨氏被立为杨妃，为“四妃”之首，地位仅在皇后长孙氏之下。
封德彝被加封为正二品侍中，成为门下省的最高官员，位列宰辅高位，萧禹被加封为从二品秘书监，成为秘书省的最高官员，也位列宰辅高位。大唐施行三省六部制，门下省就是三省之一，门下省是大唐皇帝的智囊机构，国家的大政方针皆出自门下省，最高官员侍中常伴大唐皇帝左右，为皇帝出谋划策，赞导众事，顾问应对；秘书省，熟悉大唐中央机构的官员们，都知道大唐施行的三省六部制，其实是六省六部制，另外三省分别为秘书省、殿中省、内侍省，秘书省最高官员就是秘书监，在古时，也被成为太史令，主要掌管国家的图书典藏，常伴皇帝左右，以备皇帝咨询；殿中省则负责皇帝的生活，下设尚食局、尚药局、尚衣局、尚舍局、尚乘局、尚辇局，管理大唐皇帝的衣食住行；内侍省则负责管理宫中内部事务。由于秘书省、殿中省、内侍省都是为皇帝个人服务的，所以大家都心照不宣的予以略过，对外宣称大唐施行的乃是三省六部制。秘书省、殿中省、内侍省的最高官员都被称为监，殿中监、内侍监都是正三品的高官，而秘书监则是从二品，由于秘书监掌管大唐的图书典籍以备皇帝查询，往往秘书监多有朝廷宿儒，有文名、有威望的大臣担任，大唐皇帝也对其十分尊重，不但官位上比殿中监、内侍监略高一些儿，而且秘书监也被称为宰相，大唐所有的国策，秘书监都有权力参与，并提出自己的意见。
李世民的心腹，贴身太监王富贵被擢拔为正三品内侍监，成为内侍省的最高官员。李世民的爱将、陕东道行台右仆射屈突通被大唐皇帝李世民任命为从二品东都留守，镇守东都洛阳。房玄龄、杜如晦等李世民的心腹则被陆陆续续召回帝都长安。
李玄被加封为正一品的国师，继续为大唐皇帝李世民出谋划策。高士廉依然为吏部尚书，但是食邑增加了六百户。长孙无忌也没有封赏，但是帝都长安的所有官员都知道长孙无忌就是大唐的新贵，长孙无忌既是皇帝陛下的心腹谋士，又和皇帝陛下相交谋逆，他还是当今皇后的唯一的一个亲哥哥，如此关系，想不飞黄腾达，恐怕都难啊。
大唐皇帝李世民登基的第二天，李艺就在幽州树立了反帜，正式起兵反唐，反对李世民的统治。
李世民下诏，任命李靖为元帅，秦琼、尉迟敬德、程咬金、张公瑾、段志玄、李绩为大将，率领左右武卫、左右骁卫、左右领军卫、左右威卫、左金吾卫九卫大军共计三十万大军讨伐叛乱的燕王李艺。李世民知道只有以最快的速度，最强大的实力彻底击垮李艺，自己才能树立威信，震慑四方，因此他派出了最能战的李靖和自己几乎所有的力量，但是他对李靖还不太放心，又任命自己的心腹秦琼、尉迟敬德、程咬金、张公瑾、段志玄以为制衡，并任命自己心腹中的心腹、贴身侍卫段常为监军，以防李靖有二心。段常，今年只有三十岁，可是他很小就跟随李世民，多次用身体为