自卫阶段，或者把战斗限制在与“进攻你们的人”作战和从敌人的控制下解放穆斯林的土地。一般认为这是当今穆斯林的状况。
最终阶段，是为开辟在不信者的土地上确立安拉的统治的道路的阶段，就像先知的伙伴们和他们之后的穆斯林统治者们所做的那样。“你们为什么不为保护主道和解放老弱妇孺而战呢？他们常说：‘我们的主啊！求你从这个虐民所居的城市里把我们救出去。求你从你那里为我们委任一个保护者，求你从你那里为我们委任一个援助者。’”在伊斯兰教看来这种圣战是巅峰，履行这种圣战与安拉契约的一部分，舍弃这种圣战对穆斯林而言是蒙羞和失败的原因。圣战是不可停止超过十年，一超过十年就要再开战，但要在开战前通知对方。
教义拉登根据伊斯兰教义，“圣战”是“为主道而战”即穆斯林的护教“战争”，是所有伊斯兰教徒（穆斯林）最重要的宗教义务之一。《古兰经》记载：“为主道阵亡的人，你绝对不要以为他已死去，其实他们还活着，在真主那里享受给养…谁为主道而战，以致杀身成仁，或杀敌致果，将赏获重大的报酬。”阵亡的殉道者称为“烈士”，得到最大激励，还能永住乐园，成为穆斯林的最高斗争理想。
《古兰经》中允许战争的经文表明，战争只能作为击退侵略和铲除暴政的手段；军事胜利不应导致扩张和控制财富，或者使某个种族凌驾于另一个之上。在伊斯兰教看来，伊斯兰国家受命在地球上确立正义，而这要求穆斯林们面对不义和压迫并且要根除它们的原因，而不是掌握地球和奴役人民以及主宰他们的福利，而是没有任何可疑意向地在地球上确立真主的话语。《古兰经》要求信众们为真主的事业而战，不夹带任何世俗的意向。“恶”意味着超越了限度。当人们趾高气扬地奴役他人和剥夺他人的权力并且占有财富时，就超越了限度，战争就是为恶而战的战争。
恐怖主义恐怖主义古兰经教义以仁爱和平公义为主，但也容许在公义的前提下，发动“圣战”。中世纪随着阿拉伯人的文化水平日渐提高，甚至超越同期的欧洲。然而因“圣战”观念，他们自始就产生了一个暗杀军政要人的传统，也是当代激进伊斯兰恐怖主义组织的历史根源。
伊斯兰先知穆罕默德死后，集宗教、政治和军事于一身的继任者哈里发（??）由各领袖公举。伊斯兰教的历史中，最开始的四位正统哈里发除第一位外其余三位都是被行刺而死。自第四位哈里发“阿里”开始，伊斯兰教分裂成三派即正统派（逊尼派）（ees）。阿里被“哈瓦立及派”于661年刺杀；阿里派系遭到*控大马士革军政权的穆阿维叶的清除，穆阿维叶（uawiyah，第五位哈里发）自封为哈里发并建立了倭马亚王朝（uayyad），至此哈里发已成世俗的军政领袖；“阿里派系”残余否认穆阿维叶的权威并组成什叶派（es）退往伊拉克，后到波斯（今伊朗）建立根据地，以恐怖主义行动攻击其它伊斯兰教徒。
伊斯兰教的恐怖主义暗杀传统，到在10世纪前后，从“什叶派”分离出一个更激进教派“伊斯玛仪派”，其教规奉教和专门刺杀敌人，被其他国家称为alahidas，中文史籍称为“木剌夷”（木剌夷国）。木剌夷国弱人少，但靠专业暗杀令各国畏惧。在叙利亚这教派名为hin，读音为assissin，即为“刺客”一词的辞源，“木剌夷”完全靠恐怖主义立国，后在蒙古人西征时被摧毁。
十字军东征十字军东征后，伊斯兰世界遭到侵略，“圣战”观念受到大肆吹捧，其时组织了一批被称为ufahedin自杀敢死队，意即“信仰战士”，专门以自杀方式攻击敌人。当今这个词汇被阿富汗游击队所采用，先是反苏联，继而是反美和反西方。阿富汗的塔利班组织，就是这种“信仰战士”的部队，原属阿富汗南部的杜兰尼部族，信奉巴基斯坦激进逊尼派的迪奥宾（deoband）派，追求纯正古兰经教训，反对非伊斯兰国家干预国家事务，要求赶绝所有外国人，支持者大多为地区性的部族，都是单纯而未见过世面的农民和牧民。其教规重视清修，与世隔绝，不准信徒读书、照相、看电视电影，连运动、下棋、放风筝等游戏都不容许。由于激进逊尼派，与激进什叶派势极端对立，曾企图攻灭什叶派圣城aza-i-shaif（阿里墓所在地）与伊朗亦剑拔弩张。其背后则受巴基斯坦及沙特阿拉伯的激进逊尼派支持，军力约2到3万人。沙特富商本?拉登与之趣味相投。拉登为也门人及巴勒斯坦人后裔，父亲为富商，曾就读于沙特kingabdulaziz大学（kingabdulazizunivey）读管理。在阿富汗抗苏时，资助巨型防空洞，其所住的山洞竟装有冷气机。其兄sali1989年在美国得克萨斯州意外身亡，拉登仇恨西方特别是美国文明。在1991年美军进驻沙特阿拉伯，攻击伊拉克。拉登十分愤慨，认为沙特是先知的圣地，包括圣城麦加及麦地那在内，是不容许非伊斯兰教徒践踏，因而极端反美。
3教会解释编辑十字军东征按照基督教的角度来说，中世纪时的基督教会以收回圣地为名而发动的十字军东征是一场违背上帝之意的战争。发动“圣战”的主体是基督教，战士均为基督徒以及骑士阶层。“圣战”没有经典上的依据，整个《新旧约圣经