而就在天启把卡卡西托付给水门之后不久，果然忍界开始爆发了第三次忍界大战，而且这次大战的激烈程度更胜以往。
由于近几年的和平发展，岩忍村已经恢复了二战之前的水平，而现在担任岩忍村的三代土影的大野木，为了替自己的师傅二代土影报仇，并且消除最强大的对手木叶村，于是开始暗中联络其他忍村准备联手对付木叶。
大野木相信凭借着四大忍村的实力一定可以打败木叶，一直没有参战的实力强大、野心勃勃的雷忍村果断答应了岩忍村的请求，同意与岩忍一起对付木叶。
而在砂忍这边，经过几年隐忍的发展已经恢复实力的砂忍，在同样有着远大理想的三代风影的带领下，也开始向岩忍村靠拢，准备打败木叶。
至于雾忍村，由于雾忍村是二次忍界大战受到的损失最重的忍村，不仅被攻破村子，连两代水影也被天启干掉了，导致村子出现极度的危机，在被斑控制的四代水影矢仓上台之后，又开始对付村子内部的血继限界的家族，所以可以说现在雾忍是五大忍村里最弱的一个，雾忍村的实力到现在还没能恢复过来，所以雾忍村并没有参加对木叶的战役。
于是第三次忍界大战就是由岩忍村、雷忍村还有砂忍村共同对付木叶忍者村的战役。