光绪十五年正月二十七日（1889年2月26日），是钦天监选定的皇后入宫吉日。午正三刻，是奉迎皇后的吉时。光绪帝头戴珠冠身着龙袍，升坐太和殿，文武百官三跪九叩，礼部官员宣读册封皇后的诏书。奉迎正使和副使待光绪帝回宫之后，率领着奉迎大臣们前往后邸迎接皇后入宫。与此同时，瑾、珍两嫔也由神武门被迎入后宫。
在婚期过后，隆裕住进东六宫之一的钟粹宫。但光绪帝只宠幸珍妃，和隆裕之间感情很不好。光绪应知慈禧太后之所以会挑选隆裕为皇后，是想用亲侄女来监视自己，因此而对她多有防备。姿色并不出众，且性格柔懦，身为皇后既不得宠，在宫中也得不到慈禧太后的欢心，平日与诸命妇王妃见面时也不太有威信。
不喜欢也就算了，光绪皇帝还经常捉弄隆裕太后。根据晚清太监的回忆，光绪皇帝每次经过隆裕寝宫的时候，都会非常气愤，而且他养的狗在隆裕寝宫前也是随地大小便。好歹人家也是后宫之主，光绪在老佛爷那里受的气没地方出，就把隆裕当成出气筒。
隆裕的容貌虽不太出众，不过她是一个非常有涵养的女性。光绪对她的种种举动她本可以告诉慈禧，但是她并没有这样做。在德龄公主所写的《紫禁城的黄昏》一书中，笔下的隆裕太后是一个很有教养的女性，德龄公主对隆裕赞赏有加。
光绪二十六年（1900年），因八国联军攻入北京，在联军攻入紫禁城前夕，皇后随着慈禧太后、光绪帝和其余宫眷一同逃往西安。
光绪二十七年（1901年），一行人再度回到了紫禁城。在珍妃死后，皇后依然不得宠。
光绪三十四年（1908年），光绪帝在南海瀛台涵元殿驾崩，依慈禧太后遗命由宣统帝即位。依宣统帝之命被尊为隆裕皇太后，被称为“兼祧母后”，上徽号“隆裕”，史称隆裕皇太后。宣统帝登位时年仅三岁，因此由太后抚养宣统帝。同时隆裕太后也实行垂帘听政，和摄政王载沣 共同主掌风雨飘摇的清王朝。
隆裕不善于巴结于人，所以亲信不多。自当了太后，时有秉裁军国大政，她才知道要守住太后的宝座，必须要保住溥仪的帝位，这就必须要建立自己的势力，尤其是与那些手握实权的亲贵与外臣联合。因此，当载沣树威立信，筹建统治班底之际，隆裕也不得不想方设法笼络一些大臣，以防止载沣权力过大，而危及到自己的位置。
隆裕拉拢的对象是庆亲王奕劻，奕劻因得隆裕太后的恩宠，受封清王朝最后一个铁帽子王爷。奕劻在朝中权力很大，与练兵起家的袁世凯相互勾结，载沣一开始就决定进行有限的抵制。
有一次载沣拟提名那桐为军机大臣，请示隆裕，不想隆裕却推荐袁世凯的拜把兄弟徐世昌当军机大臣。这一下，载沣被惹火，虽然他也答应让两人同时当军机大臣，但不无警告地提醒隆裕说，只有朝廷重大事件，太后才能出面商议，这些具体政务，不必烦劳大驾。
载沣虽没明说，但隆裕心知肚明，是让她不要越位。经此一遭，本来就没什么实权的隆裕，从此就很少直接出面干涉载沣。对于幼帝只能尽母亲的责任，而对这个国家她已是有心无力。
其实，说隆裕太后可怜，是有些可怜，可是跟真正受苦受难的的那么多天下女人比，她可怜吗？从小生在皇亲贵族之家，锦衣玉食，什么事都有下人伺候。从十几岁开始就贵为皇后，在这个王朝的最后一段时间里，成了这个国家权力最大的人。
很多知内情的人，都说隆裕太后是个很好的人，或许，有些人为她鸣不平。似乎她当政的几年，没做过什么坏事，为她的前人慈禧等承担罪责不公平。其实，也不尽然。如果她没有那些前人，能继承大清江山吗？要继承不可能只继承好的方面，而不对坏的方面承担责任。所谓，风风雨雨都接受。其实，若论结局，在中国历代的亡国之君中，她的结局可能是最好的了。大可不必看三国掉眼泪，为古人伤悲。
隆裕虽然一直困在深宫，见识不是很多，其实是个很精明的人。并非像很多人说那样，遇事什么主意都没有，就知道哭。其实，对于女人来说，在男人面前哭，有时候是最聪明的做法。女强人慈禧，翻手为云覆手为雨，很多时候还萌可怜掉眼泪呢。隆裕太后只是没有慈禧那样的心机和手腕，不会像慈禧那样玩权术而已。
当袁世凯嘟囔完上奏后，隆裕太后在不停的抹眼泪的同时，还是不忘问了袁世凯一句：“不是说好了，开国民什么会决定吗？这会还没开，就么就非让我们这孤儿寡母退位呢？”
对此，袁世凯当然是有所准备，他讲了事先准备好了的几个方面的理由。
其一，其实所谓开国民会议的动议，是我们这方提出来的。唐绍仪他们在下边做了很多工作，中间也托了不少人，包括外国使臣从中斡旋。对方只有伍廷芳和少数几个人勉强同意。他们所以同意，也是因为认定国民会议肯定作出共和的决定。因为二十个省 ，对方占十四个省，他们的人多。话说回来，就算真通过了君主立宪，也没有用。到时候伍廷芳会说他是越职行事，和唐绍仪一样辞去代表职务，他签署的协议也就成了废纸一张。
其二、和谈的过程中，两方力量的对比发生了很大变化，此前，虽然我方没有把握胜他们，但还有一拼。而现在，我们根本不是他