在事件发生后，清廷按照以前的惯例，出钱抚恤遇难者家属，琉球国亦上表谢恩，由于是“化外之番”所为，本着息事宁人的精神，清廷并未给予排湾族人以任何惩罚。
从文牍当中的记载来看，清廷只是把这件事当成一件很普通的“意外事件”进行处理，丝毫没有想过这一事件过后会带来什么。
但林义哲却知道，在原来的历史中，后面发生的事便是清廷始料未及了。
日本官员伊地知贞馨、大山纲良、桦山资纪等得知宫古岛民遇害事件后就积极建议日本出兵台湾。1873年2月，日本派遣外务卿副岛种臣以“中国派遣特命全权大臣”的身分前往中国，针对宫古岛人遇害事件试探清廷的态度。清朝总理衙门大臣吏部尚书毛昶熙及户部尚书董恂答以遇害之宫古岛人皆已接受中国之抚恤及遣返处理，此事件与日本无关。副岛种臣则强调琉球为其属地，并且问为何清朝不惩办台番，毛、董则以“生番不服王化”为理由推搪。“化外之民”的说法便成为日本出兵台湾的依据！
后来日本出兵台湾虽因沈葆桢带舰入台交涉而失败，但琉球却最终亡于日本之手。明治天皇密令大山纲良，以日本王政一新的名义，要求琉球遣使赴东京庆贺，明治天皇接见琉球国尚泰王派遣之使臣尚健、向有恒前往东京庆贺，琉球方面并不知日本之意图。明治天皇召见了使臣后，颁布了诏书，改琉球国为琉球藩，并册封尚泰为藩王。至1875年，日本强逼琉球终止向中国朝贡，复在1879年迫使琉球国王尚泰移住东京，正式吞并琉球。
日本吞并琉球的消息传到中国，给中国朝野上下造成了巨大的冲击。士大夫们叫嚷着要和日本开战，恢复琉球政权，他们普遍认为，如果能够使琉球复国，则不妨答应日本在商务方面“一体均沾”的要求，以展示天朝宗主国的“宽容之度”；如果琉球不但不能复国，日本反而还多所要挟，则朝廷惟有厉兵秣马与日本决战，以武力帮助琉球收复国土！
士大夫们不但表现得无比强硬，而且还十分乐观地认为战之必胜：“挞伐之师理直气壮，当必有胜算独操者；东瀛近来债负山积，兵气不扬，船则敝而不堪，兵虽强而不盛，加以理曲气馁，何以御我？”((www.2345xs.cc 2345小说网全网最新)，小说更好更新更快!
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