放着威胁更大的建虏和流贼不管，朱由检却决定先平西南土司叛乱，实在大出群臣意料之外。在他们看来，土司叛乱不过是癣疥之疾，远不足以威胁朝廷的根基，似乎用不着大动干戈。
朱由检也懒得和他们多解释，直接把万历皇帝搬了出来。这下大臣们立刻没词了，因为“万历三大征”里确实包括平定土司叛乱。如果反对皇帝用兵，那就等于说神宗这一仗也打错了。诋毁先帝，谁敢？
其实朱由检当然有自己的盘算。做为穿越之人，他深知后金和流贼这两股势力都不是那么好对付的，即使自己能扭转乾坤战而胜之，也必须做好艰苦的持久战的准备。
对后金，现在缺乏有效的打击手段，只能凭借坚城防守，增兵不但起不到多大效果，还会加重朝廷的负担；对流贼，只要民生没有大的改观，老百姓仍然有饿死的危险，那么流贼就会此起彼伏，野火烧不尽，春风吹又生，单靠军事打击是不成的。
而相较之下，西南虽然看着不起眼，却正是用兵之地。首先，朝廷对土司的政策是羁縻，而朱由检向来反对羁縻政策。在他看来，羁縻之地都存在分裂的隐患，自己绝不能把这个问题再遗留给后代解决。
而在所有羁縻之地中，贵州和四川是处于内陆的。比他们更靠近边疆的广西、云南，反而已经实现了改土归流，朝廷对这些地方可以进行有效的管理。所以相对而言，贵州和四川的问题是比较容易解决的，因为那些土司只能在有限的范围内折腾，不会像蒙古人、女真人那样，有辽阔而荒凉、明军之力难以企及的大后方。
而根据老人家的战略思想，应该集中优势兵力，各个歼灭敌人；并且先打弱敌，在打击敌人的同时壮大自己，绝不打无准备、无把握之仗。从这个角度来说，土司也应该是优先打击的对象，因为不管他们再怎么折腾，毕竟实力有限，完全可以速战速决。
若能快速平定土司叛乱，好处也是显而易见的。首先，朱由检刚刚经历了“辽东之败”，需要用一场及时的胜利挽回面子，巩固自己的权威；
第二，抛开贵州不说，四川位于中国腹地，土地肥沃，人丁兴旺，是重要的战略大后方，不容有失；
第三，贵州和四川乃是通往西南边疆的必经之路，两省若乱，则边疆地区只会更乱；两省安定，边疆也会安宁不少，朝廷才能心无旁骛地对付后金和流贼；
第四，朝廷可以借着这个机会继续推行改土归流，尽快实现对这些地区的有效管理。
因此朱由检当机立断，立即决定首先对西南用兵。
有了黄道周等人的前车之鉴，这次倒是无人敢公然反对朱由检的决策了。但是他们生怕皇帝又一时兴起御驾亲征，于是赶紧提出了若干具体方案。
其实这些方案都大同小异，无非是皇帝降旨，调动广西、云南、湖南、湖北、陕西等邻省卫所官军入黔、川助战，区别只是调动谁罢了。
朱由检却深知这些地方卫所久疏战阵，战斗力基本为零，吃空饷的情况却是有过之而无不及。若指望这些官军平叛，即使能成功，也必拖上个三年五载，耗费大量钱粮。而朱由检的目标是迅速平叛，他听罢群臣保荐的文臣武将，在心中一一盘算，觉得没有一支部队可以完成这个任务。
此时已近正午，朱由检宣布散朝，明日再议。大臣们并未多想，因为贵州、四川与京师远隔三千里，就算决策再快，传达过去也得十天半个月，倒也不差这一时。
不过朱由检可没打算再和大臣们商量，他立即降旨召见李定国、郝永忠、解胜和李来亨。不到一个时辰，这四位青年将领已经赶到乾清宫觐见。
除了李来亨之外，朱由检已经与其他三人分别将近一个月了，此时见面感到格外亲切，爽朗地笑道：“朕急着见你们，大概你们还没来得及吃午饭吧？朕也没吃，就等着你们呢。梅剑，通知炊事处马上开饭！”
这几位都是朱由检当秦王时的老部下，没少和他出生入死，已经随便惯了。此时没有其他大臣在场，也就不再拘束，放开肚皮和朱由检吃了一顿御膳。
其实所谓御膳，也不过是四菜一汤。但荤素搭配，营养丰富，味道可口，几人吃饱喝足，脑门上都见了汗，真是畅快至极。
“都吃饱了吧？嘿嘿，朕的饭可不是白吃的。”朱由检奸笑道，“先说说，这段时间你们整顿三大营的情况如何？”
郝永忠脾气最急，率先禀道：“圣上，末将奉旨暂时统领三千营。过去听说这三千营是三大营中最精锐的，末将一带才知道，简直是驴唇不对马嘴！什么精锐，三千营下辖六十四卫，定员六万四千人，实际连三万都不到，其余都是空额。就这两万多人，还有将近一半老弱病残，连马都上不去，还能打什么仗？末将勉强选出八千人，随秦兵一起训练，剩下的练也练不出来了。但他们都是军户，末将也不知道如何处理，还请圣上定夺。”
李定国暂管五军营，解胜暂管神机营，情况与三千营也大同小异。说起三大营官军的素质低下，几人均是连连摇头。郝永忠更是瞪了李来亨一眼道：“就你小子会讨圣上欢心，跟圣上去了一趟辽东，不但打得痛快，还几乎没折损兵力，大功一件是跑不了啦。哪像我们几个闷头带一帮废物，简直是费力不讨好！”
“喂喂喂，郝大哥，小弟也没得罪你啊，