却说朱由检与皇后蕊儿、德妃包玉怜相见之下当众落泪，唬得周围的文武军民跪倒一片，口中皆呼“万岁”。
不过这其中有不少大臣是颇不以为然的，觉得朱由检乃是九五之尊，理应胸怀天下，不该做此儿女之态；倒是老百姓们觉得这位年轻皇帝和自己一样，也是有血有肉、有喜有悲的平常人，而不是高高在上、没有感情的玉皇大帝，不禁对他的亲近感大增。
不过小别重逢毕竟是喜事，朱由检也赶紧拭去泪水，又接见后面的东林六君子。两年多不见，六人皆是激动万分，杨涟和左光斗更因没有双腿，只能坐在车上，仅用两臂支撑着向朱由检叩首。
朱由检忙将六人一一搀扶起来，诚恳地道：“六位先生遭此大难，不光是阉贼陷害，朝廷也难辞其咎，朕在此向你们赔不是了。”
左光斗忙顿首道：“若不是陛下以身犯险营救我等，德妃娘娘又为文孺兄与草民亲施手术，吾等早为齑粉矣！”
“朕看几位虽然瘦了些，但精神还不错，这两年是怎么过来的？”朱由检关切地问道。
这六人之中最为心直口快的周朝瑞爽朗地笑道：“我们几个隐居在山村中，白天挥锄种地，晚上以茶代酒，谈古论今，可比在朝为官时逍遥自在多了！杨兄与左兄行动不便，就在村中教授小童读书识字，亦可自食其力。说句不恭的话，若不是蒙陛下专门派燕将军传旨召见，我们几个还真舍不得离开那小山村呢！”
众人闻言皆开心地大笑起来，朱由检也笑道：“如此说来，倒是朕扰了几位的清兴了。不过现在阉贼已除，百废待兴，朝廷正在用人之际。还望几位先生以社稷和天下百姓为重，重新返朝为官，则国家幸甚！”
一直沉默寡言的杨涟听了忙道：“他们四个当然要奉诏入朝，不过草民与遗直已是残废之人，不堪为用…”
朱由检赶紧打断他道：“杨先生千万不要有此想法，残疾怎么了？只要身残志坚，一样可为国效力。想那罗斯福身患小儿麻痹导致瘫痪，却成了美国历史上最伟大的总统…”
“罗斯福为何人？‘美国’又是哪里的番邦？”杨涟等人皆大奇道。
朱由检这才意识到自己又说漏了嘴，忙尴尬地笑道：“嘿嘿嘿，朕不过是举个例子。那什么，六位皆官复原职！”
几人忙叩头谢恩，杨涟却还固执地道：“可是草民与遗直无法行走，在朝堂之上有碍观瞻。朝中饱学有风骨之士何其之多，草民不愿占着廷臣之位，让外邦以为我大明无人！”
左光斗也坚辞官职，朱由检见二人又上来了那股执拗劲，也只得无奈地笑道：“杨先生当年在诏狱写下血书，‘大笑大笑还大笑，刀砍东风，于我何有哉’，那是何等气魄，今日怎么有这么多顾虑呢。也罢，既然二位先生不愿上朝，朕还有两个紧要位子要烦劳二位。京师与南京国子监的原国子监祭酒都是阉党一派，已被朕免职了。二位既然在小山村中可以教小童读书，那出任国子监祭酒，为国传道授业应该也没问题吧。这次可不许推辞，否则朕要生气了！”
杨涟与左光斗其实当然也愿意继续为国效力，见朱由检如此为他们悉心安排，自是感激不已，顿首受职。而且以二人的才学风骨，尤其是左光斗原来就做过会试考官，做国子监祭酒（相当于大明最高学府的校长）自是游刃有余。
朱由检就于车前宣旨，任命左光斗为京师国子监祭酒，杨涟为南京国子监祭酒。由于南京路远，杨涟又刚长途跋涉而来，允其在京休养一个月再赴任。
这“东林六君子”在大臣和百姓中颇有名气，此时见朱由检不但为六人昭雪，还全部重用，自是欢声雷动。其中有三个年轻人喝彩的嗓门最大，朱由检不禁侧目，却惊讶地叫出声来：“怎么是你们？”
原来这三人正是他在一年多前密赴登州之时，在函谷关夜遇的三位青年才俊黄宗羲、顾炎武和王夫之！
朱由检赶忙来到三人跟前微笑着道：“三位，觉得朕面熟么？”
三人本来夹在人群之中，离朱由检较远，也没认出这位年轻的皇帝。此时定睛细看，黄宗羲却失声叫道：“你不就是那个尤…”
顾炎武忙扯了他一把，黄宗羲猛然醒悟，三人赶紧跪倒行礼。朱由检把他们搀起来亲切地道：“你们是来京师参加恩科么？”
当今天子，竟是当年大车店中的小行商，而且还不忘旧情！黄宗羲与王夫之均激动得说不出话来，只有顾炎武还把持得住，沉声禀道：“回陛下，草民等正是要参加恩科。除此之外，听说陛下要在天桥亲审阉党成员，黄兄之父即是被阉党害死在狱中的，他愿出堂作证，为父洗冤！”
朱由检喜道：“很好，那么我们公审时再见，朕也提前祝你们考场得意，鱼跃龙门！”
三人自是千恩万谢，周围的大臣们却是交头接耳，不知道皇帝怎么会认识三个不起眼的学子，还如此重视他们。而朱由检自然知道这三位在历史上的分量，也懒得理会众臣的鄙夷目光。
见完东林六君子，朱由检又望见了恭谨地侍立在蕊儿和包玉怜身后的梅兰竹菊四姐妹。这时他也抽出工夫来到四女跟前笑道：“你们也一路辛苦了。”
四女没想到朱由检在这么重大的场合还能顾到她们，慌忙跪倒谢恩。还是蕊儿体贴地悄声笑道：“万岁勿要吓到她们。不过她们在王府中的日子也