《圣歌》所讲述的是「工程师」种族大逃亡的历史。
早在几千万年前，「工程师」就在这个美丽的蓝色星球扎根生活。
他们是具有智慧且勤劳的种族，随着时间的发展，他们的社会经济和科学技术飞速的发展着，成为这个星球金字塔顶端的生物。
就像现在的人类一样，统治且践踏着这个星球。
「工程师」致力于研究基因工程，因为他们在广阔的星辰大海中发现了许多外星文明，强烈的危机感让他们渴望强大，所以他们希望通过生化武器来抵御外星系未知生物的迫害。
于是聪明的「工程师」一族创造了黑水病原体。
起初黑水病原体仅仅是用来“切割”dna的工具酶，适用于改在dna的双螺旋结构。
但生物世界充满了不确定性，黑水病原体发生小概率的突变，从开始的“切割”作用变成了分解聚合作用。
「工程师」惊喜于它的突变，因为再次聚合dna就代表着新基因的出现，也是新生物诞生的前奏。
这在「工程师」的科学史上是一次跨时代的发现，自此生物研究发生了质的飞跃。
经过数年的研究，「工程师」创造了第一种新的生物——异形
外形丑陋不堪，血腥残忍，没有智慧，只凭借本能杀戮。
它们生命力强大，繁殖速度奇快，简直就是为「工程师」量身打造的生化武器。
有了这么一支可以随意挥霍的异形大军，「工程师」在星际大战中所向披靡，战无不胜，隐隐有了星际霸主的地位。
又过了几百年，「工程师」彻底成就霸主地位，其他的一些低级文明无一不向其俯首称臣。
他们的异形大军在星际中扬名，其残忍血腥的手段让其他文明又怕又恨。
美丽的地球被「工程师」治理得繁荣昌盛，「工程师」更是将地球视作种族家园。
但私｜欲和贪婪是无限的，基因工程创造的生化武器带来的巨大的好处不断引诱着他们，于是「工程师」开始渴望拥有更加高级的生化武器。
异形虽然强大，但其智力低下，只能当杀戮的机器，「工程师」便把研究中心放在了对智力的开发上。
这一段研究之路，「工程师」走得格外艰辛。
时间在岁月时光中流转，在日复一日的失败中斗转星移。
「工程师」的科学家老死一批又一批，渐渐积累大量的研究经验，终于在某一天他们研制出了失败的半成品——人类
这些生化武器与他们「工程师」的外形十分相像，有着分工明确的四肢，有着可以思考学习的大脑。
但唯一的，巨大的缺憾是——他们基本没有武力值，身体弱小，在异形面前不堪一击。
「工程师」们已经疲于研究，于是将这些半成品放养在大自然中，任由其发展，观察他们的进化发展历程，试图在其进化中加以改造，看看能不能将失败品挽救回来。
然而「工程师」万万没想到的是，人类的发展进化速度如此之快，人类的学习和适应环境的能力也令人咋舌不已。
理所当然的，「工程师」开始忌惮人类，他们几乎能见到了人类未来的发展史。
用不了多久，这些失败的半成品将成为与他们「工程师」并肩的存在！
直到这时候，他们才幡然醒悟——真正强大的生化武器不是强韧的身体，而是智慧。
这样算来，人类是成功的生化武器，可是，这样强大的生化武器他们却不得不销毁。
因为智慧需要在一定限度内才能为我所用，超出可控制的智慧范围就必须销毁！
然而并不是所有的「工程师」都主张销毁人类，有小一部分「工程师」认为，人类已经是一个独立的种族了，如果私自销毁就是违反了星际条例。
不过，毕竟这些只是少数「工程师」的观点，大部分还是认为必须销毁人类，于是渐渐的其内部出现了分歧，一些几百年残留下来的社会弊端也在这次分歧中渐渐暴露出来。
「工程师」种族内部起了非常严重的内讧。
外星系六大文明得到消息，举兵攻入地球，休养生息了几个世纪的外星文明兵力强盛，带着复仇之心，将「工程师」打了个措手不及。
大战持续了数年，敌人像是下定决心一般要将「工程师」踩进泥土里，最后竟将异形大军击溃，「工程师」一族唇亡齿寒。
十年后，「工程师」大败，伤亡惨重，被外星文明逼到绝路，不得不逃离家园，逃离地球。
于是乎一小部分不赞成销毁人类的「工程师」被流放到地球，眼睁睁的看着自己的同胞驾驶飞船驶向浩瀚的星河。
被流放的「工程师」和人类在这片土地上继续生活，然而外星文明并不打算放过被流放的「工程师」，于是将其赶杀殆尽。
而不了解人类的外星文明实在看不上弱小人类物种，便不再理会，从地球撤军离开，人类得以有了发展的空间和时间。
这些历史在太航u型甬道的壁画上都有记录，只是人们还不能完全去解读理解其中的细节。
还有，冉琛一行人在甬道内看到的空壳飞船也是当初逃亡的「工程师」所留下来的。
还有那些全息投影，谭沣留下的笔记，北区郊外的别墅地下……关于「工程师」的一切都被这首《圣歌》解读。
外星文明撤军之后，人类用事实证明了他们的智慧。
在不到一万年的时间里