太和殿后面的中和殿李从认为这里没有必要保存了，所以新皇宫中就没有这个地方了。
内廷的正门名乾清门。在它的前面是一扁长的庭院，俗称横街。横街的南面是保和殿，保和殿后北面直下三层台基即到达横街，所以这里是外朝和内廷的交接部分。乾清门位于横街之北，居中面向南，它是一座面阔五开间，单檐歇山屋顶，下有白石台基的殿式大门。乾清门的规格比三大殿的正门太和门略低，在门的两旁各有一座琉璃装饰的影壁呈八字形分列左右。这对影壁为砖筑，红墙上有琉璃檐顶，下有琉璃须弥座，壁面的中心和四角也都有琉璃装饰。这个地方最主要的作用就是前朝跟后庭的分界线，所以这里也是李从要保留的。
乾清宫是后三宫的主要大殿，在明朝和清朝初期，乾清宫一直是皇帝和皇后的寝宫，高米，宫外形为面阔九开间，重檐庑殿式屋顶，左右还有昭仁殿和弘德殿两座小殿相连。两尽间为穿堂，可通交泰殿、坤宁宫。平时除皇帝居住外，也经常在这里召见宫臣，披阅奏章，处理政务，甚至还在殿中接见外国使臣，刚才的太和殿可以说就是集团最大的会议室，这个乾清宫可以看作是未来帝国的皇帝办公室，这个也是必须要有的，至于休息室什么的，按个也都是要有的。乾清宫是内廷的正殿，殿内的正中有宝座，内有“正大光明”匾。两头有暖阁。乾清宫是封建皇帝的寝宫。清康熙前此处为皇帝居住和处理政务之处。清雍正后皇帝移居养心殿，但仍在此批阅奏报，选派官吏和召见臣下。这些内部的摆设李从认为也是应该有的，毕竟皇宫就是一个摆设，难道李从还真要在这里办公么。
交泰殿在乾清宫和坤宁宫之间，含“天地交合、安康美满”之意。其建于明代，清嘉庆三年（公元1798年）重修，是座四角攒尖，镀金宝顶，龙凤纹饰的方形殿。明、清时，该殿是皇后生日举办寿庆活动的地方。清代皇后所谓亲蚕典礼，需至此检查祭典仪式的准备情况。清代的“宝玺”（印章）也收藏在这里。要是按照李从的想法。这里是可以省略的。但是无奈李从的老婆们可是不愿意的，尤其是即将要成为皇帝的周雨，这就更加的不愿意了。
除此之外，紫禁城中还有一个重要的数字秘密，如同古埃及神秘的金字塔，紫禁城建筑中也暗藏着许多数字，学者们力图从数字中解读紫禁城营建者设置的密码，探讨隐藏在这些数字背后的神秘法则。
后寝二宫乾清宫和坤宁宫组成的院落，南北长度为218米，东西宽度为118米。两者之比为6∶11；前朝三大殿太和殿、中和殿、保和殿组成的院落，南北长度为437米，东西宽度为234米，二者之比也是6∶11。同时前朝院落的长、宽几乎是后寝院落的两倍。前朝的院落面积就是后寝的四倍。后宫部分的东西六宫和东西五所，长宽尺度与后寝院落基本吻合。华夏古代皇帝有“化家为国”的观念，所以建造皇宫时以皇帝的家，也就是后寝为模数，按比例规划前朝与其他建筑群落。
明代奉天殿，面阔九间，进深五间，二者之比为9∶5；太和殿、中和殿、保和殿共处的土字形大台基，其南北长度为232米，东西宽度为130米。二者之比也刚好为9∶5；**东西面阔九楹，南北进深五间，二者之比仍为9∶5。古代数字有阴阳之分，奇数为阳，偶数为阴。紫禁城中前朝部分宫殿数量皆为阳数，而后寝部分宫殿数量则皆为阴数。阳数中九为最高，五居正中，因而古代常以九和五象征帝王的权威，称之为“九五之尊”。在中轴线上的皇帝用房，都是阔九间。深五间，含九五之数。九龙壁、九龙椅、八十一个门钉（纵九，横九）、大屋顶五条脊、檐角兽饰九个。九龙壁面由0块组成（含九），故宫角楼结构九梁十八柱。故宫内总共房间数为9999.5间，亦隐喻“九五”之意。
清代的太和殿（即明奉天殿）。面宽并不是九间，而是十一间。无法印证以上说法。实际上，这是因为奉天殿在李自成进京后被毁，清康熙八年（1669年）重建时，老技师梁九亲手制作了模型，却因找不到上好的金丝楠木，只好把面阔改为十一间，以缩短桁条的跨度。也有人认为，宫殿建筑包括殿宇开间体现等级区别，明代以九间为最尊贵，清代以十一间为最尊贵。
太和门庭院的深度为130米，宽度为0米，其长宽比为0.65，与黄金分割率0.618十分接近。紫禁城最重要的宫殿——太和殿位于中轴线上，在中轴线上，从大明门到景山的距离是2.5公里，而从大明门到太和殿的庭院中心是1.5045公里，两者的比值为0.618，正好与黄金分割率等同。
紫禁城宫殿门的门钉通常都是每扇九路，每路九颗。数字在这里成为衡量等级地位的尺度。作为最高的阳数，“九”在紫禁城的建筑中频繁出现。“九”的谐音为“久”，意为“永久”，所以又寓意为江山天长地久，永不变色。
此外，还有一些无法解释的“意外”。太和殿脊兽的排列顺序是：龙、凤、狮子、海马、天马、押鱼、狻、豸、斗牛、行什（猴）。多了一个行什。古代建筑上的脊兽，行什仅出现过一次