另外经过大半年的初步建设，香港那边的港口基础设施，已经具备了初步使用的条件，而且于孝天也开始在广东广西那边，推行他在福建这边搞的一套办法，对所有出海行商的商船，都开始收取规费。
而且包括福建这边的规费，全部都提价到了每年三千两银子，交钱可以出海，不交钱，嘿嘿，那么你的船出海之后，再回去的可能性就很低了。
虽然这样的规费价格真不算低，但是对于海商们来说，却还是可以承受的，羊毛出在羊身上，交了这钱，自然要想办法赚回来，而这些东西，是要卖给欧洲人或者是南洋一带的人的，所以涨价销售就可以了。
另外以前因为两广一带海盗丛生，海船出海之后，被劫的几率很高，但是现在两广沿海都已经被于孝天的海狼控制，单单是在两广海面上，于孝天就投入了大大小小的缉私船数百条之多，投入人员过万还多，只要交了钱之后，在南方的海面上基本上就可以保证安全。
这样一来，海商们就算是再不情不愿，也只能交钱买路，实际上对于他们来说，还是有好处的。
但是对于一些背后有靠山的大海主，于孝天这样的做法很显然就触犯了他们的利益，他们往往是连大明的赋税都从来不交的，而且大明历来对于商业方面的收税很低，对于他们这些大贾们，更是很少触及他们的利益。
现在于孝天突然间提出要交钱出海，不交规费就别想出海，他们手头往往有船只不少，一条船三千两银子，十条船就是三万两银子，这银子他们觉得花的冤枉，所以倒是真有人不交的。
但是于孝天的手下们才不管你背后靠山多大，底子多硬，只要不交钱，没拿到通海的令旗，那么对不起，近岸先不理你，跟着你等你走远之后便下手，这些做通海贸易的大贾们，过了一阵子之后，才发现他们的船失踪了，连人带货还有船，都没了踪影，这才意识到问题所在。
他们有心去告，但是现在他们的船在哪儿出的事，怎么失踪的都不知道，加上大明始终没有正式开放通商，出海做买卖，本身就是走私犯法的事情，告状都没地方告，官府更不会因为这事儿，就去开罪于孝天。
于孝天这么做，着实开罪了不少手眼通天之人，不少人开始到处运动，一直捅到了京师之中。
到了崇祯九年底的时候，朝野对于于孝天的弹劾以及非议已经越来越多，本来于孝天平靖两广沿海，九年初的时候，崇祯还勉为其难，给于孝天下旨进行了一番褒奖，擢升于孝天为都督同知，升为了从一品官衔。
可是到了九年底之后，朝野之间涌出了大量的对于孝天的弹劾之声，朝中也有很多官员，矛头指向了于孝天，有很多人上奏，说于孝天近一两年来，跋扈异常，除了圈占台员岛为他的私产之外，到处掳掠人口，充实他的台员岛人口。
另外于孝天拥海自重，在海上对通海船只收取高额规费，方能出海，据此敛财无数，并且除了福建水师和福建陆师之外，还豢养了数万私军，意图谋反。
还有就是有人启奏，说于孝天旗下的海狼，目前在海上擅开边衅，去年底的时候，夺占了朝鲜王朝的济州岛，今年中的时候，更是挥师南下，到越南黎朝那边，攻占了一大片地方，如此下去，将会养虎为患，还是请朝廷尽早将其剪除为妙，以免今后为祸一方！
崇祯九年，对于朝廷来说，又是一个难过的一年，虽然崇祯在八年的时候，擢升卢象升督军东南，洪承畴主西北，几省会剿流民军，多少见到了一些成效，可是崇祯九年期间，山西却又出现大旱。
不光山西，河南等地也同样大旱，河南南阳一带，易子而食的情况十分普遍，树皮草根皆被饥民吃光，饿死的人不计其数，道路上到处都是饿殍。
为此崇祯闻奏之后，下旨拨银赈济，但是整个山西和河南灾区，却仅仅是拨发了三千五百两的赈济银，这三千五百两银子，面对着等待赈济的百万民众，实在是少得可怜，根本就是杯水车薪。
四月间建奴奴酋皇太极在关外坐北朝南，登基称帝，五月底便发兵再次南下掠食，从喜峰口等地攻入关内，七月建奴军攻入京畿之地，连破昌平、顺义、宝坻（今属天津）、定兴、安肃（今河北徐水）、大城、雄县、安州等近畿州县。
整个京师再次告急，八月唐王朱聿键闻讯毅然起兵准备赴京救援，但是走到开封却被诸官拦住，因为他此举乃是大明皇家之大忌，大明皇帝生怕这些亲王执掌兵权起兵谋反，所以崇祯下旨，将唐王朱聿键废为庶民。
这一次建奴入关，对大明的打击颇重，自从上一次建奴破关而入之后，建奴已经看出了大明的虚弱，认为大明不过尔尔，以前他们还没敢想过面南背北的称皇，可是现在大明的虚弱，让他们变得胆子越来越大了起来。
在建奴心目之中，对大明的最后的一丝敬畏，这个时候早已烟消云散，到了这个时候，建奴已经兴起了争霸中原的心思。
而这一次建奴入关，某种程度上算是又一次对大明的试探，而他们此次的试探结果，却是相当理想的，建奴军破关之后，进入京畿之地，连克十余座京畿周边的州县，明军屡战屡败，丝毫挡不住建奴的兵锋。
这一次建奴的入关，对于大明的根基打击甚重，更大大动摇了大明这座大厦，时至此时，天下有点眼界