随着对沙俄帝国战役的结束，朱有孝开始对小玉兹汗国、希瓦汗国等采取经济合作，军队的战斗就非常少了，为了更重要的经济建设，朱有孝继续将一部分部队变为建设兵团，让他们继续留在那里，充实边疆地区的人口，如果短时间内发生战争，还可以拿起武器继续参加战斗。
孙传庭坐镇秉忠堡堡，成为新成立的朱堡行省总督，管理这个行省的一切军民事务，张秉忠主官军事训练，副手是贺人龙，硕垒坐镇朱堡，变成了纯粹的地方行政官，巴图尔成为西平城新成立的西平府巡抚，负责这一地区的军民事务。
朱有孝安排好这些地方事务以后，便将毛文龙的部队全部调回北京，这家伙属于好战分子，打理地方事务还不如他手下的几个干将，最起码像孔有德、尚可喜还做过后来清朝的藩王，而毛文龙现在只是朱有孝培养的战将，他的三大部下现在也是彪悍的战将，他们不能闲下来，需要继续在部队发挥特长。
毛文龙的部队经过精简，最后留下一万人的规模，三大部下每人各带三千精锐，毛文龙自己则留下一千士兵做护卫。这一万精锐的士兵既有作为骨干的基层军官，还有更多的是从近年战斗中表现突出的新兵，人数虽然不多，但是战斗力非常恐怖惊人。
至于从毛文龙部退役的士兵，朱有孝却没有让他们集体转业变成建设兵团，而是把他们交给了郑三炮，让他驻扎在那个无名小镇，不过现在已经有了名字了，新名字就叫做定军堡，士兵们摇身一变成了武警部队，郑三炮就成了朱堡行省的武警司令，负责地方的安全，这是一只新型的武装形式，将主要负责地方治安，必要时也会参与正式战斗。
毛文龙的部队整编好以后，朱有孝将他们留在京城继续训练，武器装备方面继续保持最先进的配备，朱有孝并不是想让这支部队守卫京城，那样太浪费了，现在京城就算是没有一个士兵卫戍也是安全的，老百姓安居乐业，官员们辛勤处理事物，外敌也根本到不了这里，朱有孝的目的是要将这支精锐的部队送给朱由检，成为朱由检的武装力量核心。
自从天启六年末将朱由检召回京城以后，朱有孝便将许多日常国家管理的事情都交给他打理，起先是为了防止自己突然出事后引起动荡，后来看到自己没有任何意外发生，就重新做了计划，继续让朱由检代替自己的日常管理，锻炼他的领导能力。
经过近两年的考验，朱有孝发现朱由检的能力确实出众，不但是保持了前世的刻苦勤奋，而且还非常注意锻炼自己的体质，不会发生未老先衰的事情，再就是朱由检的多疑、寡断性格不见了，反而是非常善于听从大家的意见，还非常有自己的主见，完全具备了一个合格君主的条件。
自从朱有孝将朱由检安排和毛文龙一起出战开始，朱有孝就打算把毛文龙送给朱由检，让朱由检拥有强大的军队，忠心的将领。毛文龙确实也没有辜负自己的期望，把他送过去的士兵训练办法加以实践，训练出一支彪悍、凶猛的军队，这次的西征战役，就是毛文龙的考试答卷，毛文龙做的非常合格，这就更加坚定的朱有孝的决心。
宋康年是朱有孝早就给朱由检准备好的军师，也就是朱由检以后的宰相人选，朱有孝也早早的就把他交给了孙承宗去*，无论是军事还是经济、政治上的才华，这家伙是一学就会，而且非常精通。朱有孝从心眼里稀罕这样的人才，宋康年真不愧是李自成的大宰相，相比于牛金星这家伙太喜欢享受强多了，但是各人都有自己的长处，敛财方面牛金星就比宋康年厉害多了，现在还是朱有孝的大金库。
朱有孝将朱由检叫道自己的书房，兄弟二人坐在一起，做了一次彻底的长谈，向他交代了自己的真正目的，除了自己是穿越过来的秘密以外，其他的关于建立一个什么样的国家、社会制度等话题，一一向朱由检做了解释，让朱由检非常吃惊。
朱有孝说：“兄弟呀，先帝早逝，仅仅留下我们兄弟二人两个男丁，而且为兄前些年身体孱弱，只好让你受尽苦头，百般受尽劳累，不但要接受严酷的军校学习，还要外出学艺，目的是万一为兄出现意外，你就可以接受国祚，延续大明的辉煌。既是为了开疆拓土，也是为了给你扫平竞争对手，这才将诸多堂兄弟安排到海外立国。”
“如今看到他们一个个混的风生水起，为兄就打算让你也出去闯荡一番。现如今在北美的傅冠、赵率教、满桂几人，在那个地方还仅仅是占据了一部分沿海地区，这也是我给你留下了以后发展的余地。我打算让你带着毛文龙的一万精锐士兵，还有宋康年这个军师，你们一起出发前往北美，继续在那里为大明开疆拓土，占领更多的土地。”
“到了那里以后，立刻就要建立起和大明本土一样的各种学校，无论是技术学院还是军事学院，都要进行建设，其次就是进行完全的免费义务教育学校，无论是不是大明本土的孩子，就算是当地的土著居民的孩子，也要进行免费的义务教育，将大明的文化传统在那里传承下去，成为第二个大明。”
“南部那里已经有了我们两个海外领地，你可以和他们联合协商如何在那里发展，只要我在世一天，他们独立的可能性不大，你可以尽量的和他们合作，至于以后的事情，就要看你自己的本事了，是否让他们独自