锦衣卫的名字即使是在三百多年以后,也是大大有名的,更是武侠小说和古装影视剧中的常客。
既然穿越到这个时代，商毅自然也对锦衣卫做了一番全面详细的研究:锦衣卫的全名为“锦衣卫亲军都指挥使司”,和后来的东厂、西厂一样，都是明朝的特务机构，合称为“厂卫”。
锦衣卫分有南北两个镇抚司：南镇抚司主管一般卫、所部队人员的犯罪侦查、审讯、判决、情报以及军事武器之研发事项，等同后世之宪兵队、军事法院、军事检查署以及军备局的结合体。而北镇抚司主管各地藩王及官员秘密监视、肃反肃贪，独立侦讯、逮捕、判决、关押拘禁（诏狱）以及反间谍事项。类似于后世美国国家安全局、联邦调查局、香港廉政公署的综合体。
一般来说，北镇抚司的权力要大于南镇抚司，因为北镇抚司有专理诏狱的权力，可以不经三法司授权，直接听命于皇帝取旨行事，并在狱成之后，甚致可以不通过锦衣卫指挥使，直接专达皇帝。而且就是在锦衣卫中，官不掌诏狱者，亦不得干预其事。同时北镇抚司也参与收集军情、策反敌将的工作，如在朝鲜万历之战中，就收集了大量的日军军情，保证了明军的胜利。
后世对锦衣卫的评价也是褒贬不一，毁誉参半。因为锦衣卫拥有相当的特权，无形中也令他们有资本可以胡作非为、而又得到了皇权的庇护，不会被追究责任，造成了社会的动荡和朝廷的混乱，以及当时人们对锦衣卫的恐惧。在后世甚致有人说明朝不是亡于流寇，而实是亡于厂卫。因此总体来说，锦衣卫还是毁多于誉，由其是在魏忠贤独掌大权的时代，流传着许多关于锦衣卫的恐怖传说，虽然其中有相当一部份是东厂、西厂做的，但在一般人看来，厂卫实际是一体的。
而正因为如此，到了崇祯时期，魏忠贤倒台之后，在朝廷中要求取消锦衣卫的呼声也越来越大，崇桢虽然并沒有取消锦衣卫，但也戒于魏忠贤的教训，还是极大限制了锦衣卫的行为权力，所以终崇桢一朝，锦衣卫也没有闹出什么事来。不过因此也有人认为，正因为崇祯时期，锦衣卫权限大为削弱，才使官员缺少了监督，导致官场腐败变本加厉，也间接引起大明朝的灭亡。在后世，关于锦衣卫的功过得失，也引发过不少口水大战。
商毅不想对锦衣卫进行多评价，但对他们还是敬而远之为好，由其是在自己还没有成势之前，更不想和锦衣卫扯上什么关系，只是事情并不按他的想法发展，倒底还是遇上了锦衣卫。
不过抱着即来之则安之的心里，商毅跟着来人，来到了这群锦衣卫中间。
大概是因为被穆陵军所救的原因，这群锦衣卫对商毅还比较客气，没有拿腔作势，不过这也许和锦衣卫在崇祯时代并不得志有关。通报了各自的姓名和身份之后，商毅才发现，这批锦衣卫的来头到不小。
带头的是同知沈扬，佥事刘知用、镇抚赵从夫、周威，其余还有千户四人、百户四人、总旗、小旗、力士、校尉等等。
商毅听完他们的身份后，也吓了一跳，他知道，锦衣卫官员设有指挥使一人，正三品，同知二人，从三品，佥事二人，正四品，镇抚二人，从四品，十四所千户十四人，正五品，此其下管理职尚有副千户，从五品、百户，正六品、试百户，从六品、总旗，正七品、小旗，从七品等。下属还有将军、力士、校尉等职位。那么这一次锦衣卫出动了一个二把手，一个三把手、两个四把手，这个阵容可不算小了。
原来清军破关南下以有五个多月的时间，在此期间，大明朝廷调集大量兵马，设了昌平、保定二总督，宁远、永平、顺天、保定、密云、天津六巡抚，宁远、山海、中协、西协、昌平、通州、天津、保定八总兵，号称兵力三十九万五千余人，然而还是挡不清军的铁骑，任其如入无之境一般。
各路的明军不但不敢与清军交战，在谎报战功上，却是人人都有一手，今天你报获胜，明天我就报大捷，你说斩首三百，我就说杀敌一千。只是一开始还能报胜利，但时间一长问题就出来了，既然明军老打胜仗，那为啥清军还不撤走，反而是继续南下呢？
于是众将的口锋也就慢慢转变了过来，虽然也报了一些败绩，但也要强调是因为自己孤军无援，寡不敌众，仍然浴血奋战，杀死多少多少敌军，因见敌势众大，放才暂时避开一时。还有的人更绝，说什么与敌奋战十数仗，我亦未胜、敌亦未败等等。
崇祯也做了十几年的皇帝，那还不明白众将的这些套路，心里自然是又气又急，差一点就要杀几个立威，但就在这时，曾化龙将商毅第一次穆陵关胜利的大捷报到了北京。看到了这份久违的捷报，崇祯也不禁是又惊又喜，和过去那些冒功的捷报有所不同，这份捷报十分详细，不仅把战斗过程描写的十分清楚，连所杀的那些身份清兵，都写得十分淸楚，到不像是假冒战功。
但取得胜利的这个商毅是何许人也，崇祯可是一点印像也没有，于是去问文武百官，虽然捷报说商毅是穆陵关千总，但也没有一个官员说得出这个人的来历，又去查档案，还是一无所获，那么就只有一种可能，这个人是刚刚被提拔起来的，人事档案还没有送到北京来。
因此崇祯不禁又犯了嘀咕，一个名不见经传的小小千总，能够有这么大的本事