路要一步步的走，饭要一口口的吃，赵佳与苏辙等人自然也都明白这个简单的道理，因此他们在经过最初的商议过后，决定还是将接下来的任务分为两步走，第一步就是解决掉教廷的问题，另外赵佳还要掌握一部分完全属于他的领地，至于第二步则比较麻烦了，那就是解决神圣罗马帝国内部诸侯林立的局面，这件事牵一发而动全身，所以被赵佳暂时放到最后。
大的方向确定了，接下来就是具体的实施了，这对于行政经验丰富的苏辙等人来说，根本不是什么大问题，第二天他们就随同赵佳回到罗马，然后开始搭建统治罗马的行政机构，整个机构的核心还是大宋的那种君、相互为牵制的政治二元制，虽然皇帝在名义上统治着整个帝国，但其实皇帝也只是掌握着军事大权与大臣的任免权，至于平时的行政事务则大都分都交给几位相公处理，当然为了保证皇帝的权力，皇帝对政务的处理意见还是拥有一言否决的权力，而且遇到特别重要的事情时，皇帝也可以加入到政务的处理决策之中。
苏辙这次带来的不少人都是像游师雄这种行政经验丰富的官员，有他们这些人在，很快就在罗马城中搭建起一个临时的行政核心，接下来就是阿格尼丝正式宣布登陆为帝，她本来就是神圣罗马帝国皇帝的继承人，而且现在又打败了自己的两个哥哥，所以在登基这件事自然没有任何问题。
而在阿格尼丝登基为帝之后，第一件事就是宣布原来的教皇帕斯卡尔二世涉嫌挑唆帝国内乱，为帝国造成极大的损失，已经不配再担任教皇的职务，因此阿格尼丝宣布废除他的罗马祭司称号，改由原来的枢机主教莫里斯担任教皇，史称格里高利八世。
对于教皇的废立，所有人都表现的十分平静，毕竟这也是意料之中的事。而且这几十年来，阿格尼丝的祖父和父亲也没少废立教皇，这让所有人早就********，甚至若是阿格尼丝不废立教皇的话。才会让人感到奇怪。
教皇的废立虽然没有引起太大的关注，但是接下来的事情却让很多人感到不解，在大部分人看来，女皇登基之后宣布了新教皇的人选，那么接下来肯定就是要让新教皇为她加冕。这样她的皇位才能更加的稳固，同时也符合神圣罗马帝国皇位传承的法定程序，但是让所有人都没有想到的是，这个加冕仪式却是迟迟没有举行，这让不少有心人都在暗中猜测，是不是女皇那边发生了什么新的变故？
不过也就在所有人暗自猜测之时，新任教皇格里高利八世竟然忽然宣布：神圣罗马帝国皇帝的权力来自于天主，代替天主管理万民，教皇虽然是天主在人间的牧者，但依然没有资格为皇帝加冕。所以日后神圣罗马帝国的皇帝不必再经过教皇的加冕，依然可以为帝国合法的皇帝。
上面的这个消息一出，立刻引起一片哗然，不少教士纷纷指责格里高利八世篡改教义，根本不配担任教皇，甚至更有一些脾气火爆的教士指责格里高利八世是女皇的走狗，所以他们不再承认格里高利的教皇之位，纷纷串连起来准备发动决议另立新教皇。
面对这些教士们的反对，格里高利八世却没有任何的退缩，或者说是他背后的赵佳没有任何退缩。反而再一次发动了十分强硬的反击，那就是由女皇和教皇联合发动声明，宣布解除教廷的任何武装力量，另外也废除了教廷向教徒征收的什一税。并且还规定除了帝国与各地被册封的领主外，任何人都无权向私人征收税收。
什一税是教廷最大的财政来源，早在几百年前，教廷就规定所有教徒要把收入的十分之一上缴给教廷，供宗教事业之用，可是这笔庞大的收入的大部分并没有用于宗教事业。而是被教廷的上层用于私人享用，另外还让教廷畜养了大批的教廷骑士，这些教廷骑士则成为教廷的武力保障，使得教廷加速的向外扩张，同时对内也实行更加严苛的统治，进一步促进了教廷的发展。
现在赵佳一下子砍掉了教廷最大的财政收入，而且还命令教廷解除武力，这无异于断掉了教廷的根，因此这个消息一出，立刻引发了帝国内绝大部分教士的抗议，要知道这时的教廷掌握着不小的力量，特别是各地的主教，手中有权又有军队，实力并不比贵族差多少，因此他们的反对也十分有力，甚至有几个离罗马较近的主教已经联合起来，准备趁着呼延庆的大军追捕小亨利的时机，一举攻占罗马，当然最好是能够抓住赵佳与阿格尼丝夫妇，然后再回过头来威胁呼延庆的大军放下武器。
这几个主教的打算倒是不错，可惜赵佳既然敢对付教廷，自然有着万全的把握，就在这几个主教刚刚把军队集合起来，罗马那边的大军就已经杀到了，呼延庆虽然把大军带走了，但是这次苏辙前来又带来一批将近万人的军队，至于统军的将领更是现成的，游师雄文武双全，当年就跟着张载对抗过辽军，后来又在南洋那里清剿过土人，统军能力不比一般的将领差，所以赵佳也十分放心的让他统军。
游师雄率领着一万大军，以迅雷不及掩耳之势袭击了那几个联合起来准备反抗的主教，结果仅仅用半天时间，就击溃了他们的军队，为首的几个主教除了一个逃跑之外，剩下的全都被活捉，而这些主教全都被带到罗马，然后交给新任教皇格里高利八世处置。
对于这些敢于反抗的主教，格里高利